Identificación de genes asociados con Nefropatía Diabética regulados por miRNAs: Análisis In sílico.

Rogelio Frank Jiménez-Ortega, José Eduardo Justo-Frausto, Irene Alva-Partida, Juan Fernando Montes-García

Resumen

Introducción. La nefropatía diabética (ND) es una enfermedad caracterizada por la secreción de albuminuria superior a 300 mg/dL que puede conducir al desarrollo de enfermedad renal crónica avanzada (ERCA). Objetivo. Identificar genes regulados por miRNAs asociados con ND y su papel en la patogénesis de la enfermedad a través de un análisis In sílico. Material y Métodos. A través del uso de microarreglos y análisis bioinformáticos se identificaron potenciales genes blancos de los miRNAs; hsa-miR-126-3p, miR-320a-3p y miR-1288-3p. Estos genes fueron sometidos a un análisis de vías de señalización para identificar procesos asociados con la patogénesis de la ND. Resultados. Se identificaron 57 genes blanco de los miRNAs analizados, los cuales fueron asociados con 14 ontologías genéticas y 7 vías de señalización KEGG. Estos resultados permitieron generar un modelo In sílico en el que se muestra una red de interacción entre genes blanco regulados por miRNAs cuya alteración puede conducir al desarrollo de la ND. Conclusiones. Estos descubrimientos podrían contribuir a la comprensión del mecanismo de la ND y abren el panorama para realizar nuevas investigaciones sobre genes y miRNAs que podrían más adelante podrían ser evaluados como marcadores en la detección temprana de la ND.

Texto completo:

PDF EPUB HTML

Referencias

Shen Z, Fang Y, Xing T, Wang F. Diabetic Nephropathy: From Pathophysiology to Treatment. J Diabetes Res. 2017;2379432. DOI: 10.1155/2017/2379432

Colhoun HM, Marcovecchio ML. Biomarkers of diabetic kidney disease. Diabetología. 2018;61(5):996-1011. DOI: 10.1007/s00125-018-4567-5

Staiteieh SA, Akil L, Al Khansa R, Nasr R, Al Sagheer Z, Houshaymi B, Merhi RA. Study of microRNA expression profiling as biomarkers for colorectal cancer patients in Lebanon. Mol Clin Oncol. 2022;16(2):39. DOI: 10.3892/mco.2021.2473

Leitão AL, Enguita FJ. A Structural View of miRNA Biogenesis and Function. Noncoding RNA. 2022;8(1):10. DOI: 10.3390/ncrna8010010

He M, Wang J, Yin Z, Zhao Y, Hou H, Fan J. et al. MiR-320a induces diabetic nephropathy via inhibiting MafB. Aging (Albany NY). 2019;11(10):3055-3079. DOI: 10.18632/aging.101962

Conserva F, Barozzino M, Pesce F, Divella C, Oranger A, Papale M. et al. Urinary miRNA-27b-3p and miRNA-1228-3p correlate with the progression of Kidney Fibrosis in Diabetic Nephropathy. Sci Rep. 2019;9(1):11357. DOI: 10.1038/s41598-019-47778-1

Pordzik J, Eyileten-Postuła C, Jakubik D, Czajka P, Nowak A, De Rosa S. et al. MiR-126 Is an Independent Predictor of Long-Term All-Cause Mortality in Patients with Type 2 Diabetes Mellitus. J Clin Med. 2021 May 28;10(11):2371. DOI: 10.3390/jcm10112371

Al-Kafaji G, Al-Mahroos G, Al-Muhtaresh HA, Skrypnyk C, Sabry MA, Ramadan AR. Decreased expression of circulating microRNA-126 in patients with type 2 diabetic nephropathy: A potential blood-based biomarker. Exp Ther Med. 2016;12(2):815-822. DOI: 10.3892/etm.2016.3395

Raitoharju E, Seppälä I, Oksala N, Lyytikäinen LP, Raitakari O, Viikari J, et al. Blood microRNA profile associates with the levels of serum lipids and metabolites associated with glucose metabolism and insulin resistance and pinpoints pathways underlying metabolic syndrome: the cardiovascular risk in Young Finns Study. Mol Cell Endocrinol. 2014;391(1-2):41-9. DOI: 10.1016/j.mce.2014.04.013

Lee YJ, Kim V, Muth DC, Witwer KW. Validated MicroRNA Target Databases: An Evaluation. Drug Dev Res. 2015;76(7):389-96. DOI: 10.1002/ddr.21278

Sticht C, De La Torre C, Parveen A, Gretz N. miRWalk: An online resource for prediction of microRNA binding sites. PLoS One. 2018;13(10):e0206239. DOI: 10.1371/journal.pone.0206239

Quillet A, Saad C, Ferry G, Anouar Y, Vergne N, Lecroq T. et al. Improving Bioinformatics Prediction of microRNA Targets by Ranks Aggregation. Front Genet. 2020; 10:1330. DOI: 10.3389/fgene.2019.01330

Shved N, Warsow G, Eichinger F, Hoogewijs D, Brandt S, Wild P, et al. Transcriptome-based network analysis reveals renal cell type-specific dysregulation of hypoxia-associated transcripts. Sci Rep. 2017;7(1):8576. DOI: 10.1038/s41598-017-08492-y

Delrue C, Speeckaert R, Delanghe JR, Speeckaert MM. The Role of Vitamin D in Diabetic Nephropathy: A Translational Approach. Int J Mol Sci. 2022;23(2):807. DOI: 10.3390/ijms23020807

Samsu N. Diabetic Nephropathy: Challenges in Pathogenesis, Diagnosis, and Treatment. Biomed Res Int. 2021;1497449. DOI: 10.1155/2021/1497449.

Tang J, Yao D, Yan H, Chen X, Wang L, Zhan H. The Role of MicroRNAs in the Pathogenesis of Diabetic Nephropathy. Int J Endocrinol. 2019;8719060 DOI: 10.1155/2019/8719060

Wang Z, Wang Z, Zhou Z, Ren Y. Crucial genes associated with diabetic nephropathy explored by microarray analysis. BMC Nephrol. 2016;17(1):128. DOI: 10.1186/s12882-016-0343-2

Al-Kafaji G, Al-Mahroos G, Al-Muhtaresh HA, Skrypnyk C, Sabry MA, Ramadan AR. Decreased expression of circulating microRNA-126 in patients with type 2 diabetic nephropathy: A potential blood-based biomarker. Exp Ther Med. 2016;12(2):815-822. DOI: 10.3892/etm.2016.3395

Zhang Y, Chen X, Yuan L, Zhang Y, Wu J, Guo N. et al. Down-regulation of IRAK1 attenuates podocyte apoptosis in diabetic nephropathy through PI3K/Akt signaling pathway. Biochem Biophys Res Commun. 2018 Nov 30;506(3):529-535. DOI: 10.1016/j.bbrc.2018.09.175

Agola JO, Jim PA, Ward HH, Basuray S, Wandinger-Ness A. Rab GTPases as regulators of endocytosis, targets of disease and therapeutic opportunities. Clin Genet. 2011;80(4):305-18. DOI: 10.1111/j.1399-0004.2011.01724.x

Ding Y, Tang X, Wang Y, Yu D, Zhu C, Yu J. Tetrandrine alleviates podocyte injury via calcium-dependent calpain-1 signaling blockade. BMC Complement Med Ther. 2021;21(1):296. DOI: 10.1186/s12906-021-03469-x

Guo L, Sanders PW, Woods A, Wu C. The distribution and regulation of integrin-linked kinase in normal and diabetic kidneys. Am J Pathol. 2001;159(5):1735-42. DOI: 10.1016/S0002-9440(10)63020-9

Meza Letelier CE, San Martín Ojeda CA, Ruiz Provoste JJ, Frugone Zaror CJ. Fisiopatología de la nefropatía diabética: una revisión de la literatura. Medwave. 2017;17(1):e6839. DOI: 10.5867/medwave.2017.01.6839

Du H, Yin Z, Zhao Y, Li H, Dai B, Fan J, et al. miR-320a induces pancreatic β cells dysfunction in diabetes by inhibiting MafF. Mol Ther Nucleic Acids. 2021; 26:444-457. DOI: 10.1016/j.omtn.2021.08.027

Enlaces refback

  • No hay ningún enlace refback.